金融興則港口旺，金融活則港口強，創新金融機制，激發金融活力是北部灣國際門戶港建設的重要保障。

廣西水運港口發展基金是由北部灣港集團作為主發起人、廣西投資引導基金有限責任公司代表自治區本級財政參與的私募股權投資基金組合。基金采取1+N母子基金架構，計劃總募資規模200億元。

2019年8月，西部陸海新通道上升為國家戰略。到2020年、2025 年北部灣港集裝箱吞吐量分別達到500萬標箱、1000 萬標箱，將建設自動化集裝箱、30萬噸級油碼頭、20萬噸級集裝箱碼頭等一批專業泊位，逐步完善港口設施。

為加快我區港口碼頭及配套項目建設進程、拓寬港口碼頭及配套項目融資渠道，帶動金融機構、社會資本等參與投資，水運基金按照政府引導、市場運作、不形成地方政府債務的原則，重點投資我區港口碼頭及配套項目開發建設，同時服務中國—東盟地區港航發展，以融促港，以港促通，互利共贏，攜手發展。